Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF648Q5T619 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms