Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CC2D1BQ5T0F9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CC2D1BQ5T0F9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms