Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NHSL1Q5SYE7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms