Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRMS1LQ5PSV4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms