Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC158Q5M9N0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC158Q5M9N0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms