Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COLEC12Q5KU26 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms