Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC178Q5BJE1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC178Q5BJE1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms