Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms