Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HSD17B12Q53GQ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms