Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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KRTAP13-3Q3SY46 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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KRTAP13-3Q3SY46 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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KRTAP13-3Q3SY46 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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KRTAP13-3Q3SY46 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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KRTAP13-3Q3SY46 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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KRTAP13-3Q3SY46 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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