Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF1Q3BBV0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms