Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIDA1Q1XH10 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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