Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FAM187BQ17R55 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms