Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HADHQ16836 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HADHQ16836 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HADHQ16836 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HADHQ16836 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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