Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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