Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTF1Q16619 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms