Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FXNQ16595 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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FXNQ16595 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FXNQ16595 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FXNQ16595 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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