Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDB1Q16531 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDB1Q16531 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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