Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZFHX3Q15911 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms