Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms