Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFNB3Q15768 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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