Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX1Q15699 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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