Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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