Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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RABEP1Q15276 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RABEP1Q15276 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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