Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PCM1Q15154 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms