Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CDK5R1Q15078 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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CDK5R1Q15078 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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