Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLD3Q15054 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms