Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms