Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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