Protein–RNA interactions for Protein: Q14061

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX17Q14061 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
COX17Q14061 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
COX17Q14061 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
COX17Q14061 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
COX17Q14061 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
COX17Q14061 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
COX17Q14061 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12□□□□□ -0.49
COX17Q14061 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms