Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDK13Q14004 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms