Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX2Q13950 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms