Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOFQ13790 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOFQ13790 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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