Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCOA4Q13772 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NCOA4Q13772 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms