Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FHL3Q13643 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms