Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTCH1Q13635 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
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