Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms