Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PMS2P3Q13401 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms