Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRSQ13332 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRSQ13332 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
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PTPRSQ13332 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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PTPRSQ13332 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRSQ13332 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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