Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCGQ13326 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SGCGQ13326 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SGCGQ13326 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SGCGQ13326 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SGCGQ13326 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SGCGQ13326 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SGCGQ13326 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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