Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF5Q13243 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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