Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms