Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNA1Q09470 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms