Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms