Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDR1Q08345 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms