Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EGR3Q06889 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms