Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms