Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBXN1Q04323 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms