Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERCC6Q03468 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ERCC6Q03468 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms