Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC10Q01780 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC10Q01780 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms